Первым владельцем стал Матуш Чак, фактический правитель всей западной и центральной Словакии. Замок был передан ему в 1302 году королём Венгрии Вацлавом III. В XV веке замок находился во владении короля Матьяша «Корвина» Хуньяди, который, в свою очередь, передал замок в 1489 году на короткое время своему внебрачному сыну Яношу Корвину.
Матьяш охотно посещал Бойнице и издавал здесь королевские указы. Обычно он диктовал их под своей любимой липой, известной сегодня под названием Липа короля Матьяша.
С периодом владения замком Яношем Корвином связана легенда о каменных дукатах, передаваемая из поколения в поколение. Один хромой ремесленник проклял управляющего замком Петра Пака за то, что тот не разрешил ему обмыть больную ногу водой из целебного источника, расположенного возле замка. И проклятие исполнилось:- через несколько дней ключ с лечебной водой забил около дома бондаря, а источник возле замка пересох. Кроме того, все деньги жадного управляющего превратились в круглые камешки, а ремесленник был полностью исцелен.
После смерти Матьяша замок ( как это было и со Спишским градом) сначала перешёл во владение рода Запольяи, а затем (в 1528 году ) семейства Турзо , которое произвело многочисленные перестройки. Первоначальная крепость была превращена в ренессансный замок. С 1646 года замок находился во владении рода Палфий, которые также стали инициаторами неких преобразований замка.
Один из владельцев замка.